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本文回顾中药药效物质基础的研究历程，归纳总结近十年来中药药效物质基础研究的研究思路、方法及手段，以期为其深入研究提供参考。当前，中药及其复方物质基础研究的主要思路包括结构中药学、成分敲出/敲入、中药谱效法及中药血清谱效法、中医方证代谢组学、中药整体药动学等，主要工具包括色谱技术、波谱技术、高通量筛选技术、仿生技术等。但目前研究也存在一些不足，如以单体活性成分为导向的研究方法缺乏中医药理论支持，对中药的代表性差，不能全面体现中药多成分、多靶点、多功能、多层次的特点，缺乏系统性，并且没有发现更全面完善的普适于中药物质基础研究的新方法。未来，中药药效物质基础研究应遵循中医药理论的整体观思路，遵循药效组分“质-量-效”三者之间的关系，同时要以提高临床疗效为出发点和落脚点，积极发展普适的研究方法与技术，助力中医药现代化进程。